Konvencija je zasedala v obliki plenarnih zasedanj, na katerih so bili prisotni vsi njeni člani. Do konca julija 2002 je potekalo sedem takšnih zasedanj, predsedstvo pa se je sestajalo dvakrat do trikrat mesečno. Strokovno podporo predsedstvu je zagotavljal sekretariat, v katerem so bili predstavniki generalnega sekretariata Sveta EU, Evropskega parlamenta in Komisije.
Delo Konvencije je potekalo v treh fazah:
- marec - junij 2002: identifikacija pričakovanj in različnih pogledov na prihodnjo Evropo
- junij - jesen 2002: usklajevanje predlogov in poglobljena analiza
- jesen 2002 - pomlad 2003: primerjava prednosti in slabosti različnih modelov, izbor enega izmed njih oziroma predstavitev novega predloga
Način dela po letih:
O poteku dela je predsedstvo sproti obveščalo Evropski svet.Predsednik Konvencije je na vsakem zasedanju Sveta osebno poročal o napredku dela Konvencije, svoja mnenja pa so lahko izražali tudi predsedniki vlad in držav članic.
Konvencija se je sestajala v Bruslju. Razprave in vsi uradni dokumenti so javni in v 11 uradnih jezikih Unije.