Evropska komisija je 21. januarja 1998 ustanovila posebno Delovno skupino za pogajanja o pristopu (t.i. Accession Negotiations Task Force), ki je vodila pogajanja s kandidatkami za vstop v EU.
Z reformo Evropske komisije leta 1999 je nastal nov Generalni direktorat za širitev, ki je v celoti prevzel naloge v zvezi s širitvijo Evropske unije. Generalni direktor in glavni pogajalec je bil Eneko Landaburu. Vodja pogajalske skupine za pogajanja s Slovenijo pa Jaime Garcia Lombardero.