Schengenski informacijski sistem (SIS) vsebuje dve kategoriji podatkov:
- podatke o iskanih ali pogrešanih osebah in osebah pod tajnim sledenjem
- podatke o ukradenih ali drugače odtujenih vozilih in predmetih (predvsem osebni dokumenti).
Podatki o osebah veljajo kot osebni podatki in so skrbno varovani. Zanje se v okviru SIS poleg določil Schengenske konvencije in Zakona o varstvu osebnih podatkov upošteva tudi določila Konvencije Sveta Evrope o varstvu posameznika glede na avtomatsko obdelavo osebnih podatkov.
Nabor osebnih podatkov v SIS je omejen na podatke o:
- osebah, za katere se zahteva prijetje zaradi predaje ali izročitve (95. člen Schengenske konvencije),
- osebah, ki niso državljani držav članic, za katere je razpisana zavrnitev vstopa v Schengensko območje (96. člen Schengenske konvencije),
- pogrešanih osebah ali osebah, ki potrebujejo začasno policijsko zaščito, predvsem mladoletni (97. člen Schengenske konvencije),
- pričah oziroma osebah, ki se morajo v okviru kazenskega postopka zglasiti na sodišču ali jim je potrebno vročiti sodbo ali vabilo na prestajanje kazni (98. člen Schengenske konvencije) in osebah za namene prikritega evidentiranja ali namenske kontrole (99. člen Schengenske konvencije).
Pri tem so za osebe lahko zabeleženi samo naslednji podatki:
- priimek in ime, morebiten psevdonim, po potrebi v novem podatkovnem zapisu,
- morebitne objektivne fizične posebnosti, ki se ne spreminjajo,
- prvo črko drugega imena,
- datum in kraj rojstva,
- spol,
- državljanstvo,
- ali so te osebe oborožene,
- ali so te osebe nasilne,
- razlog za razpis ukrepa,
- predlagana oblika ukrepanja.
Poleg navedenih osebnih podatkov pa SIS vsebuje tudi podatke o:
- vozilih, za katere se izvaja prikrito evidentiranje ali namenska kontrola (99. člen Schengenske konvencije) in
- predmetih, ki se iščejo zaradi zasega ali za zagotovitev dokazov v kazenskih postopkih (100. člen Schengenske konvencije).
Drugi osebni podatki, zlasti podatki o rasnem poreklu, političnih, verskih ali drugih prepričanjih, zdravstvenem stanju in spolnem življenju (občutljivi osebni podatki) niso dovoljeni. Tehnični podporni del sistema je v Strassbourgu in s prenosom informacij on-line zagotavlja, da nacionalne podatkovne zbirke držav podpisnic vsebujejo enake podatke. Temelj SIS je tako posebej varovana linija, ki kot vodnik omogoča pretok informacij, ki so zakodirane. Podatkovne baze so zaščitene, vsaka država pa ima svojo nacionalno kopijo.
V skladu s temeljnimi načeli glede varstva osebnih podatkov imajo tako državljani držav članic schengenskega območja kot tudi državljani drugih držav določene pravice, in sicer:
- pravico do vpogleda v lastne osebne podatke v SIS,
- pravico do zahtevka za popravek netočnih lastnih osebnih podatkov v SIS,
- pravico do zahtevka za izbris nezakonito shranjenih lastnih osebnih podatkov v SIS.
